پاک سازی پنبه از مواد خارجی و تصفیه آن ، از عوامل مهم ایجاد ارزش در این الیاف با اهمیت صنعتی تجاری و از عوامل سه گانه رقم بندی آن است . تصفیه پنبه در کارخانجات ویژه ای که بدین منظور در کنار مراکز تولید این ماده مهم صنعتی ایجاد گردیده انجام می پذیرد. کارخانجات مذکور موظف به رعایت نکاتی در کار خود می باشند که از جمله مواد زیر است : 1- وش های وارد به کارخانه بمنظور جلوگیری از تقلیل کیفیت آن با نظارت مامور کنترل طبقه بندی و هر رقم را بطور جدا گانه تصفیه کند.این طبقه بندی کار قسمت های مختلف کارخانه را نیز تسهیل می نماید. 2- وش رادر محوطه یا انباری که از باران محفوظ بوده و قابل تهویه باشد نگاهداری می نمایند. 3- وش های مرطوب را که بیش از (13) در صد رطوبت دارند قبل از تصفیه بوسیله خشک کن خشک کرده و سپس تصفیه کند. 4- ماشینهای تصفیه را مطابق آیین نامه و مقررات سازمان های مربوطه آماده بهره برداری نگاه دارد و قبل از بهره برداری سالیانه اجازه کار از موسسات ذیربط دریافت کند. قابل ذکر است که:خشک کردن «وش»در کار دستگاههای تمیز کننده و پاک کننده کارخانجات نیز ایجاد سهولت می کند و این کار با مجاور ساختن وش و هوای گرم صورت می گیرد.ضمنا این کارخانجات در جهت استقرار موقعیت خود باید:الف- پلمپ مخصوص داشته باشند تا پس از عدل بندی آن را پلمپ نمایند.ب- چنانچه محصول آنها برای صدور باشد پروانه صدور اخذ کنند پ- عل بندی محصولات آنها ذیل شماره ردیف خاص سالیانه صورت می گیرد. ت- علامت کارخانه را بر عدل های آماده شده حک نمایند.